Kuramsal Moleküler Biyofizik

Kuramsal Moleküler Biyofizik

Fizik kavramlarinin molekuler biyoloji problemlerine uygulamasi birbirini butunleyen iki farkli yonde olur. Bir yandan, biyolojik molekullerinin hayati islemleri onlarin fiziksel ve kimyasal ozellikleri tarafindan kisitlandigi icin, bu molekullerin gecirdigi islevsel donusumleritarif ederken kimyasal fizik dilini kullanmak onem kazanir.Ote yandan, biyomolekullerin yapisini ve dinamigini atom boyutunda algilayan en basarili deneysel yontemler bu molekullerin fiziksel ozelliklerine---mesela mekanik ve elektromanyetik kuvvetlerle etkilesmelerine---baglidir. Sabanci Universitesi’nde surdurdugumuz kuramsal molekuler biyoloji alanindaki arastirmalarimiz her iki yöne değinir.

Denge ve denge disi istatistiksel mekanik yontemlerini kullanarak, biyomolekullerin sekil degisimini molekuler dinamik (MD) simulasyonlariyla gerceklestirip tarif etmemizi saglayacak hesapsal yontemler gelistiriyoruz. Ayrica, MD simulasyonlarindaki ayrintili dinamik bilgisini kullanarak incelenen biyomolekullerin elektron spin rezonans (ESR) spektrumlarini hesaplamamizi mumkun kilacak metodolojiyi gelistiriyoruz. Temel ilkelerden yola cikarak hesaplanan ESR spektrumlarini uluslararasi kolaboratorlerimizce saglanan deneysel veriyle dogrudan karsilastiriyoruz.